本研究旨在探讨食性对鱼类肠道菌群组成和多样性的影响，并预测特定菌群对不同营养素的潜在功能。实验采用高通量16S rRNA基因测序技术，提取获得滇池高背鲫(Carassius auratus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、鳜鱼(Siniperca chuatsi)、昆明裂腹鱼(Shizothorax grahami) 4种不同食性鱼类的肠道内容物，12个样品的16S rRNA，构建文库并测序，分析这4种鱼类肠道微生物的菌落组成和多样性。结果显示，鱼类肠道菌群多样性受到食性的显著影响(P<0.05)，综合表现为杂食性(滇池高倍鲫)>草食性(草鱼)>滤食性(昆明裂腹鱼)>肉食性(鳜鱼)。4种鱼类具有一些相同的优势菌群：变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)。然而，优势菌群在属水平上存在一定差异，如不动杆菌属(Acinetobacter)为鳜鱼的优势菌群，拟杆菌属(Bacteroides)为草鱼的优势菌群等。功能预测发现，鳜鱼肠道中以革兰氏阴性菌为主；草鱼抗病潜力略高于其他3种鱼类；约氏不动杆菌(A.＿johnsonii)、鲁氏不动杆菌(A. lwoffii)和施氏假单胞菌(Pseudomonas stutzeri)可能有助于宿主对蛋白质的消化，而拟杆菌属中的某些菌群可能有助于宿主消化纤维素。综上所述，食性是影响鱼类肠道菌群组成和多样性差异化的主要因素之一，分析食性与肠道优势菌群之间的关联，探讨特异菌群的功能，可为研究鱼类营养代谢的微生物效应奠定理论基础。

采用冰冻切片、组织学染色及扫描电镜的方法对绿鳍马面鲀(Thamnaconusseptentrionalis)鱼皮组织结构进行研究。结果显示，绿鳍马面鲀鱼皮由表皮层、鳞片层、真皮层和皮下组织层构成，并据此绘制绿鳍马面鲀鱼皮组织结构模式图。表皮层由上皮细胞和基底细胞组成，其厚度为(26.81±7.48)μm；鳞片层由锥状骨质凸起和基板组成，基板厚度为(22.49±5.19)μm，基板上不均匀地分布2～4行直径大小不一、顶端弯曲程度不同、高度为(257.13±10.41)μm的锥状骨质凸起；真皮层厚度为中部>头部>尾部，平均厚度为(176.97±21.11)μm，主要由胶原纤维构成；皮下组织层主要由胶原纤维和非纤维间质构成。本研究可为开发利用绿鳍马面鲀鱼皮资源提供基础资料。

2013年以来，我国沿海各省市养殖对虾中先后出现虾肝肠胞虫(Enterocytozoon hepatopenaei,EHP)感染且感染率居高不下，使我国虾类养殖产业遭受了严重经济损失。为查明2021—2022年沿海省市养殖虾类中EHP的流行情况，本研究在沿海地区开展了养殖虾类EHP流行情况调查，共采集样品936份，并采用Taq Man实时荧光定量PCR (TaqMan qPCR)和组织病理检测对样品进行分析。TaqMan qPCR检测结果表明，2021和2022年所采集的虾类样品中，EHP的阳性检出率分别为10.67%(54/506)和13.72%(59/430);2021和2022年主要在凡纳对虾(Penaeus vannamei)中检出EHP阳性，阳性检出率分别为14.10%(54/383)和16.71%(58/347)，且检出EHP阳性的凡纳对虾主要来自山东、辽宁、广东、河北和天津等省市；1份脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)样品中检出EHP阳性，罗氏沼虾(Macrobrachium rosenbergii)、克氏原螯虾(Protocrayfish cruzi)、斑节对虾(P.monodon)、日本对虾(P.japonicus)和中国对虾(P.chinensis)等虾类样品中未检出EHP阳性。对TaqMan qPCR检测呈阳性的凡纳对虾进行组织病理检测，在其肝胰腺上皮细胞中观测到分散或成簇的EHP孢子以及处于生长阶段的EHP原质团。本研究表明，2021—2022年EHP仍在我国沿海地区养殖的凡纳对虾中流行，尽管其流行率较前几年呈下降趋势，但其对凡纳对虾养殖产业的危害仍不容忽视。

硅(Si)是地球上丰度仅次于氧的第二大元素，其生物地球化学过程与大气CO2变化、海洋生物泵以及海岸带富营养化等过程密切相关，因此，硅循环也成为全球环境变化研究关注的核心问题之一。本文在总结已有研究的基础上，论述了硅生物地球化学过程及其对碳循环的调节及影响，进一步聚焦近海规模化贝类养殖活动，分析了贝类养殖生态系统硅循环与碳循环的耦合作用及机理，展望了未来值得关注的关键科学问题。研究表明，地质尺度上，硅酸盐矿物风化是地表所有次生硅的来源，风化过程也是一个重要的碳汇过程。陆地生态系统中，植硅体较难降解，在其形成过程中会包裹有机碳而形成稳定的有机碳库，因而植硅体碳具有重大的碳汇潜力，很有可能成为全球碳汇的重要组成部分。海洋生态系统中，作为初级生产主要贡献者的硅藻(Bacillariophyta)吸收硅酸盐合成有机碳并将其打包在生源硅颗粒中向深层海洋输送并埋藏，埋藏量可占海洋碳埋藏总量的40%，生物硅泵驱动了生物碳泵；在近海贝类养殖区，通过硅藻作为滤食性贝类的饵料来源，硅酸盐成为渔业碳汇重要的物质支撑。因此，研究硅生物地球化学循环过程中，综合考虑各过程及其耦合作用是非常必要的，对深入了解其在贝类养殖碳汇中的作用及探究潜在养殖增汇途径具有重要意义。

哈维氏弧菌(Vibrioharveyi)是引起豹纹鳃棘鲈(Plectropomusleopardus)患“烂身病”的主要致病菌，每年6―8月发病率极高，严重影响了该品种养殖业的可持续发展。因此，培育抗病良种是豹纹鳃棘鲈养殖业的迫切需求。为评估豹纹鳃棘鲈抗哈维氏弧菌遗传参数，本研究基于高密度单核苷酸多态性位点构建的基因组亲缘关系矩阵，使用4种模型(BLM、BTM、LLM和LTM)拟合了2种抗病表型(测试日性状，TDS；二元死亡存活性状，TS)，并用约束最大似然法(REML)估算方差组分。经分析，豹纹鳃棘鲈抗哈维氏弧菌遗传力为0.182～0.486，属中高遗传力性状，加性遗传方差为0.071～0.262。其中，利用线性模型(BLM和LLM)估算的遗传力分别为0.382和0.476，利用阈值模型(BTM和LTM)估算的遗传力分别为0.182和0.207。表明可以通过遗传选育提高豹纹鳃棘鲈抗弧菌能力。对不同模型估算的基因组估算育种值(GEBV)进行相关性分析，不同模型拟合同种抗病表型时，GEBV之间相关系数> 0.9，属于高强度正相关关系，表明使用同种表型定义时，阈值或线性模型对GEBV排名影响很小。对不同模型估算的GEBV与不同表型进行相关性分析的结果显示，纵向模型(LLM和LTM)估算的GEBV与表型TS之间的相关系数高于横截面模型(BLM和BTM)，说明表型TDS可能比表型TS更适合作为抗病表型。此外，在线性模型中，使用表型TDS和表型TS估算的GEBV之间的相关系数<0.85，说明采用2种表型定义下估计的豹纹鳃棘鲈抗哈维弧菌GEBV排名不一致。但基于表型TDS估算的GEBV与表型TS之间的相关系数较强(0.824)，表明使用表型TDS和纵向模型(LLM)估算豹纹鳃棘鲈抗哈维氏弧菌遗传参数更有优势。本研究补充了豹纹鳃棘鲈抗哈维氏弧菌遗传参数研究，为豹纹鳃棘鲈抗哈维氏弧菌良种选育提供了参考。

急性肝胰腺坏死病(acute hepatopancreatic necrosis disease, AHPND)严重影响了我国乃至全球对虾养殖业的发展。近期研究发现，致病菌毒力质粒携带trb型Ⅳ型分泌系统(typeⅣsecretion system, T4SS)可在高菌体密度下介导毒力质粒发生接合转移，从而导致AHPND致病菌多样性。为探究群体感应与T4SS表达以及毒力质粒接合转移的关系，本研究以副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)群体感应系统的高密度调控子OpaR为研究对象，在致AHPND副溶血弧菌20130629002S01::cat(Vp2S01::cat)菌株基础上，利用同源重组技术构建opaR基因缺失株Vp2S01::catΔopaR。比较了出发菌株和缺失株在生长性能、运动性和生物被膜形成能力等方面的差异，分析了opaR基因对T4SS基因表达量以及质粒接合转移效率的影响。结果显示，opaR基因缺失不影响细菌的生长特性和群集运动，但泳动能力显著增加，生物被膜形成能力显著下降；接合转移实验显示，opaR基因缺失显著提高T4SS表达水平和接合转移效率。本研究为解析群体感应系统调控AHPND致病菌T4SS表达以及毒力质粒接合转移机制提供了基础数据，可为控制AHPND致病菌毒力质粒传播提供技术支撑。

为了筛选可用于防治虾苗细菌性玻化症(bacterial vitrified syndrome, BVS)的中药复方，本研究首先通过牛津杯法和二倍稀释法进行体外抑菌实验，从50种中药中筛选出对BVS致病菌溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)和副溶血弧菌(V. parahaemolyticus)具有良好抑菌效果的中药。然后，以不同浓度的溶藻弧菌浸浴感染虾苗，建立BVS病理模型；再通过体内药效学实验从死亡率、组织病理学和超微组织病理学角度比较不同中药复方对于患BVS虾苗的防治效果。体外抑菌实验结果显示，五味子(Schisandrae chinensis fructus)、马鞭草(Verbenae herba)、乌梅(Mume fructus)等中药对溶藻弧菌的抑菌圈直径可达12 mm以上；诃子(Chebulae fructus)、五味子、牡丹皮(Moutan cortex)等中药对副溶血弧菌的抑菌圈直径可达13mm以上。五倍子(Gallachinensis)、诃子、五味子、丁香(Caryophylliflos)对溶藻弧菌和副溶血弧菌的最小抑菌浓度(MIC)均≤12.5mg/mL，最小杀菌浓度(MBC)均≤50 mg/mL。结合香附(Cyperi rhizoma)、栀子(Gardeniae fructus) 2味中药组成3种中药复方，处方1、处方2和处方3；以5×104 CFU/mL的溶藻弧菌感染虾苗成功建立BVS病理模型，在此基础上采用药物治疗患病虾苗7d，各组死亡率由低至高依次为空白对照组、处方1组、20%氟苯尼考粉对照组、处方3组、处方2组和阳性对照组。处方1组虾苗死亡率显著低于阳性对照组(P<0.05)；处方2组、处方3组和20%氟苯尼考对照组虾苗死亡率低于阳性对照组，但差异不显著(P>0.05)。由此可见，处方1可显著降低患病虾苗死亡率。组织病理学和超微组织病理学研究显示，相比于其他感染组，处方1组虾苗肝胰腺病变程度明显较轻，肠道结构较为完整；虾苗肝小管上皮细胞的细胞膜、细胞核正常，线粒体、内质网丰富且基本正常。表明口服处方1可对患病虾苗的肝胰腺和肠道组织起到良好的保护作用，并优于处方2、处方3和20%氟苯尼考粉。综上所述，处方1 (诃子30 g、五味子20 g、香附20 g)对溶藻弧菌感染的虾苗保护和治疗效果良好。本研究结果可为研制防控虾苗BVS专用中药提供依据，助力对虾养殖绿色高质量发展。

为解析夏季高温期三倍体与二倍体长牡蛎(Crassostreagigas)摄食和代谢生理以及能量/碳分配策略的差异，于2022年8月，以三倍体和二倍体长牡蛎为研究对象，在山东荣成桑沟湾采用现场流水法测定滤水率、吸收效率、耗氧率、排氨率等摄食和代谢相关生理参数，并基于能量收支方程估算能量分配与碳分配情况。结果显示，三倍体长牡蛎的滤水率、同化效率均高于二倍体长牡蛎，但无显著差异(P>0.05)；三倍体与二倍体长牡蛎的耗氧率、排氨率存在显著差异(P<0.05)，三倍体长牡蛎的耗氧率显著低于二倍体长牡蛎(P<0.05)，但排氨率显著高于二倍体长牡蛎(P<0.01)。能量收支与碳收支的结果显示，三倍体长牡蛎的摄食能/碳、同化能/碳均高于二倍体长牡蛎，但无显著差异(P>0.05)；三倍体与二倍体长牡蛎的呼吸能/碳、排泄能/碳、生长余力存在显著差异(P<0.05)，三倍体长牡蛎的呼吸能/碳显著低于二倍体长牡蛎(P<0.05)，但排泄能/碳、生长余力显著高于二倍体长牡蛎(P<0.05)。三倍体和二倍体长牡蛎的氧氮比波动范围分别为7.91～14.11和59.81～94.19，因此，三倍体长牡蛎的主要供能物质为蛋白质，二倍体长牡蛎的主要供能物质为糖类和脂肪。研究结果为揭示夏季高温期长牡蛎倍性效应关联的能量分配方式差异提供了数据支撑。

为了探讨不同益生菌发酵饲料养殖对虾的效果，用枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)、酿酒酵母(Saccharomycescerevisiae)和嗜酸乳杆菌(Lactobacillusacidophilus)3种益生菌单一及联合发酵对虾饲料，投喂凡纳对虾(Penaeusvannamei)28d，分析对虾的存活、生长及饲料利用情况，检测对虾体内外弧菌(Vibrio)数量及非特异性免疫相关指标变化，同时比较不同组间养殖水体中氨氮及亚硝氮的浓度差异。研究表明，对虾摄食枯草芽孢杆菌、嗜酸乳杆菌及复合菌发酵饲料存活率均显著提高(P<0.05)，提高率分别达到8.54%、8.54%和9.76%；枯草芽孢杆菌及嗜酸乳杆菌发酵饲料能够显著提高对虾的体长增长率(P<0.05)；嗜酸乳杆菌发酵饲料可显著降低对虾的饵料系数(P<0.05)；投喂发酵饲料的各实验组养殖至第14、21天时的对虾肝胰腺中弧菌密度显著低于对照组(P<0.05)；各实验组中，虾血清总蛋白含量显著高于对照组，投喂嗜酸乳杆菌发酵饲料能够显著提高过氧化物酶、超氧化物歧化酶及酚氧化酶活性(P<0.05)，且在养殖末期，投喂不同益生菌发酵饲料均可不同程度地降低养殖后期水体中的氨氮和亚硝氮浓度。综上可知，3种益生菌单一或混合发酵对虾饲料对提高对虾存活率、促进生长及提高免疫力方面均有积极效果，但嗜酸乳杆菌用于对虾饲料发酵的综合效果最佳。本研究为益生菌发酵饲料在对虾健康养殖中的应用提供了理论依据。

细胞平台是研究病原–宿主互作的重要工具，虾类细胞系的缺少严重制约了虾类病毒学研究。传染性早熟病毒(IPV)是近年来发现的能够导致罗氏沼虾(Macrobrachiumrosenbergii)性早熟和生长缓慢的一种新病毒，主要侵染罗氏沼虾神经组织。为建立罗氏沼虾病毒–宿主互作的体外研究平台，本研究采用木瓜蛋白酶消化健康罗氏沼虾的脑、眼柄、胸神经节和腹神经节，获取罗氏沼虾神经细胞，并利用L-15培养基进行离体培养。选择培养效果最佳的脑神经细胞进行IPV体外感染。结果显示，培养的原代细胞在含有谷氨酰胺的L-15培养基中生长良好，其中，从脑组织和眼柄X器官–窦腺复合体中分离出的细胞在体外存活时间可达15d，从胸腹神经节中分离出来的细胞在体外存活时间达9 d。在本研究所采用的感染方式和剂量条件下，脑细胞在感染96 h后检测到高载量的IPV。本研究建立了一种操作简便的罗氏沼虾神经细胞原代培养技术，为罗氏沼虾神经内分泌研究和病毒–宿主互作提供了基础数据和平台。

自2016年河北省发生贻贝中麻痹性贝毒(paralytic shellfish toxins, PSTs)超标且中毒事件以来，该区域主产贝类中PSTs安全风险受到研究者和管理部门的密切关注。以2022年3—6月在河北省近岸采集的6种主产贝类为研究对象，采用液相色谱质谱联用法(LC-MS/MS法)分析了PSTs的残留状况并进行急性暴露评估，以了解河北省近岸贝类中PSTs污染的变化情况及消费风险。整体来看，不同贝类样品中均有PSTs检出，且4月份贝类样品风险最高，但所有样品均未超过安全限量标准；该区域贝类中PSTs主要组分为GTX1&4和GTX2&3，且紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)中含量最高，其次为毛蚶(Scapharca subcrenata)；采用最高含量进行急性暴露评估发现，所有贝类样品均处于安全可接受状态。虽然河北近岸贝类中PSTs最高含量呈降低趋势，但仍存在一定残留及安全风险，后续需持续围绕该海域进行长期性调查研究，为我国贝类毒素监管和食用安全提供基础参考数据。

声驱鱼技术作为辅助过鱼措施之一，承担着保证鱼类洄游顺利通过过鱼设施，继而保护鱼类资源和恢复河流连通性的重要作用。本研究采用交替播音的形式，以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)幼鱼为研究对象进行负趋音性实验，旨在探究草鱼幼鱼面对不同声音的行为反应。实验水槽(3.6 m×1.1 m×1.0 m)布置于下牢溪周围水域，平均水深为0.5 m，平均流速为0.06 m/s。实验使用1种单频音(1 000 Hz)和5种复杂音(鱼游动声、引擎声、短吻鳄叫声、打桩声和游艇声)，声压级(sound pressure level)为(117.69±2.77) dB re 1μPa，对照组为未播放声音时草鱼的行为反应数据。结果显示，播放复杂音时，草鱼的反应次数、趋音速度、运动时间比均显著高于单频音和对照组(P<0.001)，草鱼的初次反应时间、平均反应时间均显著低于单频音和对照组(P<0.001)；复杂音中，受到游艇声刺激的草鱼反应次数和趋音速度最大，受到鱼游动声刺激的草鱼反应次数、趋音速度最小；复杂音中，受到游艇声刺激的草鱼初次反应时间最短，为(23.40±5.13)s；受到引擎声刺激的草鱼初次反应时间最长，为(146.00±7.82) s，显著低于其他复杂音(P<0.05)；受到游艇声和打桩声刺激的草鱼平均反应时间最短，分别为(26.52±3.01) s和(28.76±4.07) s；受到鱼游动声刺激的草鱼平均反应时间最长，为(64.76±17.82)s；复杂音中，受到鱼游动声刺激的草鱼运动时间比最高，为(98.47±0.48)%；受到引擎声刺激的草鱼运动时间比最低，为(94.58±0.54)%；播放单频音时，草鱼的反应次数、初次反应时间、平均反应时间、运动时间比均与对照组无显著差异(P>0.05)。本研究表明，5种复杂音(鱼游动声、引擎声、短吻鳄叫声、打桩声和游艇声)对草鱼幼鱼具有驱赶效果。本研究在丰富鱼类负趋音性研究的同时，为实际工程中声驱鱼辅助过鱼设施的设计和优化提供了科学依据。

养殖水体中的微生物群落结构及功能组成对养殖生态系统具有重要作用。为了全面系统评估中华绒螯蟹(Eriocheirsinensis)养殖中后期水体微生物群落结构和功能组成，于2022年6―10月逐月监测上海市崇明区中华绒螯蟹养殖池塘内水质指标，同时基于宏基因组学技术分析了养殖期内水体中微生物物种组成及功能结构特征，并探讨了二者与环境因子的关系。结果显示，该养殖池塘在养殖中后期主要超标水质指标为p H、高锰酸盐指数、总磷和总氮。在养殖期水体中，6―8月的微生物群落多样性以及7―8月的微生物群落丰富度处于较高水平，优势门为细菌中的变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和病毒中的尾噬菌体门(Uroviricota)，而在属水平上，丰度占比前10的优势属在多组之间均存在显著差异，如7月蓝藻门微囊藻属(Microcystis)细菌和8―10月的有尾噬菌体目(unclassified＿o＿Caudovirales)病毒丰度明显高于其他月份。微生物的主要功能为代谢功能包括能量代谢、全局和概览图、氨基酸代谢等，不同月份的功能组成存在显著差异，尤其是6―7月代谢途径丰度明显高于8―10月，而优势细菌变形菌门、放线菌门和拟杆菌门是上述功能的主要贡献者。环境因子对微生物群落结构和功能组成的影响趋势一致，叶绿素a和pH是影响最显著的环境因子，溶解氧、总磷的影响作用稍弱。在养殖水体中，丰度占比较大的致病菌为肠道沙门氏菌(Salmonella enterica)、爱德华氏菌(Edwardsiella ictaluri)和金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。研究结果可为中华绒螯蟹养殖池塘水体微生物群落结构和功能组成研究提供基础数据，并可为养殖水质调控及生态系统构建提供理论依据。

为摆脱常规核酸样品提取步骤繁琐、耗时等问题，实现真正的现场快速检测，本研究致力于研制和优化一种对虾肝胰腺中DNA样品的核酸快速制备试剂，即核酸释放剂，适用于重组酶聚合酶扩增技术(recombinasepolymeraseamplication,RPA)与侧向流层析试纸条技术(lateralflow dipstick, LFD)结合的RPA-LFD技术检测。实验优选20～100 mmol/L Tris-HCl、50～250 mmol/L KCl、0.01%～0.10%十二烷基硫酸锂(LDS)、0.5%～2.0%聚乙二醇辛基苯基醚(TritonX-100)、1～5mmol/L乙二胺四乙酸二钠(EGTA2Na)、0.5～5.0 mmol/L牛血清白蛋白(BSA)、1～5 mg/mL明胶、0.01%～0.10%海藻糖、1%～5%甜菜碱等配制成核酸释放剂。以对虾肝肠孢虫(Enterocytozoonhepatopenaei,EHP)阳性样本和阴性样本对核酸释放剂各组分间配比进行优化，采集绿豆大小的对虾肝胰腺组织加入100μL核酸释放剂，100℃加热3 min，取上清液进行RPA-LFD反应，测试各组分不同浓度配比；并以对虾急性肝胰腺坏死病(acute hepatopancreatic necrosis disease, AHPND)阳性样品及阴性样品作为检测模板对优化后核酸释放剂再次验证。结果显示，核酸释放剂的各组分最佳配比为100 mmol/L Tris-HCl、100 mmol/L KCl、0.02%LDS、0.5%Triton X-100、1 mmol/L EGTA2Na、0.05%海藻糖、1 mg/mL明胶、0.5 mmol/L BSA、2%甜菜碱。RPA-LFD方法检测可显著区分阳性和阴性样品。本研究优化的核酸释放剂，适用于RPA-LFD检测对虾肝胰腺病原DNA样品的制备，有效避免了常规DNA样品繁琐、耗时的制备步骤，极大地提高了核酸水平病原检测效率。

虹鳟(Oncorhynchusmykiss)是我国冷水性鱼类的主要养殖品种。与二倍体相比，虹鳟三倍体具有生长速度快、肉质好和不育等优点。目前，鉴定虹鳟倍性主要是通过流式细胞术进行DNA含量分析，但这种方法需要采集鱼类血液或组织样本，会对其造成伤害。为了实现利用微创方法收集样本鉴定虹鳟倍性，本研究利用PCR扩增以及电泳分离技术对153个微卫星标记(SSR标记)进行分析，其中139个SSR标记能够在二倍体和三倍体中成功扩增，筛选出132个SSR标记具有多态性，最终鉴定出7个标记在三倍体中表现出较高的变异性。通过在52个已知倍性水平的参考样本和48个未知倍性的样本上进行验证，进一步从中筛选出3个SSR标记(SSR1054、SSR1056和SSR1468)足以区分倍性水平，并且根据3个标记序列重新设计了3对具有良好稳定性的引物序列进行倍性分析应用。本研究所筛选的SSR标记解决了现有虹鳟倍性鉴定中存在的技术流程复杂、耗材昂贵的问题，并有助于不同倍性虹鳟的遗传多样性研究。

夏季高温会引起半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)的应激，甚至造成死亡，是工厂化养殖的重要影响因素之一。为探究高温胁迫对半滑舌鳎肝脏氧化损伤及热应激相关基因的影响，本研究选取半滑舌鳎一个全同胞家系为实验对象，通过连续升温达到高温胁迫条件(35℃)后，分别在0、3、6、12和24 h采集肝脏组织，进行苏木精–伊红染色法(HE)和TUNEL染色并观察细胞损伤情况，测定抗氧化酶活性及丙二醛(MDA)含量并检测应激相关基因heatshockprotein familyAmember1A(hspa1a)、 heatshockprotein90betafamilymember1(hsp90b1)和dual-specificity phosphatase 1 (dusp1)的表达变化。结果显示，急性高温胁迫会造成半滑舌鳎肝脏组织发生明显病理变化并出现细胞凋亡；超氧化物歧化酶(SOD)活性在高温胁迫6 h时显著高于对照组(P<0.05)，谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)活性在高温胁迫12h时显著高于对照组(P<0.05)，过氧化氢酶(CAT)活性在高温胁迫0h时显著高于对照组(P<0.05),MDA含量在高温胁迫24h时显著高于对照组(P<0.05)；热休克蛋白基因hspa1a和hsp90b1分别在高温胁迫0 h和3 h时显著上调表达，热应激相关基因dusp1在高温胁迫3h时显著上调表达。综上所述，急性高温胁迫下，半滑舌鳎肝脏发生氧化应激，短期内机体可调动抗氧化系统加速清除活性氧，并激活热应激相关基因表达。该研究可为解析半滑舌鳎对高温胁迫的响应机制、预防夏季高温大规模死亡的发生以及开展耐高温良种的选育等提供参考。

发展深水网箱养殖是保障我国粮食及食品安全的长远战略，也是缓解近海网箱养殖环境胁迫力、拓展食物生产空间的必然选择。发展深水网箱养殖首先需要面对的突出挑战是养殖设施在外海恶劣海况下的安全性问题。网衣是深水网箱的主体结构，由于其自身具有高柔性、小尺度的特点，在波浪和水流作用下易出现大位移和大变形的极端响应。当前，网衣结构分析技术已成为我国深水网箱养殖工程技术的薄弱环节，一定程度上制约当前海上养殖网箱向大型化和深水化发展。因此，网衣水动力特性研究对于深远海网箱养殖的发展具有重要意义。本研究系统介绍了计算网衣水动力荷载的主要方法及其适用范围。同时，对网衣动态响应数值计算中的主流建模技术进行了总结和分析。最后，根据目前网衣水动力特性研究中存在的热点问题，提出了网衣流固耦合分析、生物污损分析、数字孪生技术等前沿发展方向，为网衣水动力学分析向数字化、精准化发展提供参考。

缢蛏(Sinonovacula constricta)为广盐性贝类，自身存在抵抗外界盐度胁迫的渗透调节机制。为探究缢蛏在适应盐度胁迫过程中发挥渗透调节作用的主要游离氨基酸(freeaminoacids,FAA)及其降解途径，本研究测定了不同盐度(5、20和35)胁迫下缢蛏组织的渗透压、FAA含量，并结合其肌肽合成酶基因(carnosine synthase, Sc-CARNS)的表达及相关生理指标的变化研究了Sc-CARNS基因的功能。结果显示，缢蛏鳃、足和血淋巴中渗透压和总游离氨基酸含量随着盐度的升高而升高，且各组织渗透压都在盐度胁迫24h后达到稳态。此时，缢蛏鳃、足和血淋巴中随盐度变化含量变化最明显的FAA分别为Ala、Gly、Glu、Pro,Ala、Gly、Arg、Tua和Ala、Ser、Thr、Gly。前期研究结果显示，在缢蛏盐度胁迫转录组中，Sc-CARNS表达上调，与盐度调节相关。Sc-CARNS在缢蛏肌肉型组织中表达量最高。低盐胁迫下，Sc-CARNS m RNA表达量和肌肽含量显著升高(P<0.05)，丙氨酸(Ala)含量变化趋势与肌肽相反。受RNA干扰后，正常盐度和低盐胁迫下，Sc-CARNS基因在足中m RNA表达量和肌肽含量先下降后升高，丙氨酸含量变化则相反，48h干扰效率和含量变化最高，且肌肽与丙氨酸是1∶1的转化。结果表明，缢蛏属于渗透压随变者，体内FAA中的丙氨酸在渗透调节方面的贡献率最大，肌肽合成酶(CARNS)是丙氨酸代谢为肌肽的关键酶，参与渗透压调节过程。本研究揭示了低盐胁迫下缢蛏渗透压调节的关键机理，为揭示竹蛏科(Solenida)贝类独特的盐度耐受性机制提供了依据。

为了探究长江十年禁渔后安庆江段刀鲚的生境履历，利用X射线电子探针微区分析技术研究安庆江段不同类型长颌刀鲚(Coilia nasus)和短颌刀鲚的耳石Sr和Ca微化学特征。结果显示，根据耳石Sr/Ca值的变化值将安庆江段的短颌刀鲚分为2类，一类是其比值为一直小于3.0的低值，表明其纯淡水的生境履历；另一类是其比值不仅有小于3.0的低值区，还有大于3.0的高值区(小于7.0)，表明其不仅有淡水的生境履历，还有高盐度的河口半咸水生境履历。长颌刀鲚的耳石Sr/Ca值均具有小于3.0的低值区和大于3.0 (甚至大于7.0)高值区的显著波动，表现为典型的淡水、河口半咸水及海水的溯河洄游型生境履历，Sr含量面分析图谱也可印证上述结果。本研究表明，长江安庆江段刀鲚群体组成较为复杂，同时存在溯河洄游型、淡水定居型短颌刀鲚和溯河洄游型长颌刀鲚3种生态表型个体。

为探明绿鳍马面鲀(Thamnaconusseptentrionalis)性腺发育相关基因表达特征，优化亲本生殖调控技术，本研究对绿鳍马面鲀雌雄亲体的精巢和卵巢进行了转录组测序分析，经de novo拼装，最终获得119 219个单基因(unigene),N50长度为1 255 bp。在NR、NT、KO、Swiss Prot、PFAM、GO及KOG数据库分别注释到24 009、35 057、18 453、26 971、30 294、11 420和21 613个unigene。绿鳍马面鲀精巢和卵巢转录组中存在18 954个差异表达基因(DEG)，相对于精巢，在卵巢中上调表达的基因有11 265个，下调表达的有7 689个。选取bmp2、sox3、figla、hsd17b1、cyp19a、cyp17、foxl2、star和amh 9个DEGs进行实时荧光定量PCR (qRT-PCR)验证，结果显示，qRT-PCR结果与RNA-Seq分析相一致。GO和KEGG富集结果分析发现，amh、cyp17和star可能在绿鳍马面鲀雄性精子发生过程中起关键作用；bmp2、foxl2、cyp19a、figla和hsd17b1在雌性卵子发生和卵巢类固醇生成过程中发挥重要作用。本研究通过比较绿鳍马面鲀精巢和卵巢的转录组表达差异，初步阐明了精巢和卵巢的基因表达特征，为进一步研究绿鳍马面鲀的性腺发育机制奠定了基础。

动物中普遍存在性别生长二态性，这种现象在海水鱼中更为明显。半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)性成熟雌鱼体重显著高于雄鱼，雌性个体的生长速度比雄性快2～4倍。本研究旨在探究rimoc1基因在半滑舌鳎雌、雄鱼中的表达差异及与性别和生长的关系。实时定量和原位杂交结果显示，rimoc1在雄性组织中未检测到表达，而在雌性组织中表达量最高的是卵巢和肌肉，在卵巢中表达相对稳定，在孵化后1.5年(1.5yph)和3yph的水平有所增加。在细胞系中通过si RNA干扰敲除rimoc1后，发现生长相关基因igf1、性别分化相关基因sox9b和foxl2的表达水平显著降低，而sox9a的表达升高。启动子活性分析显示，rimoc1启动子可能受到C/EBPdelta、Sox2和c-Jun等转录因子的调控。推测rimoc1可能在半滑舌鳎的性别分化和生长中发挥重要作用，为深入研究半滑舌鳎的性别生长二态性提供了基础。