莲雾实时荧光定量PCR内参基因的筛选和验证

魏秀清, 章希娟, 许玲, 陈长忠, 许家辉

果树学报. 2018, 35(04): 402-411

果树学报 ›› 2018, Vol. 35 ›› Issue (04) : 402-411. DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20170409
论文

莲雾实时荧光定量PCR内参基因的筛选和验证

  • 魏秀清, 章希娟, 许玲, 陈长忠, 许家辉
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摘要

【目的】莲雾果实品质不稳定和冬季低温寒害是生产上的两大问题,筛选稳定可靠的内参基因,以便开展莲雾品质形成和低温胁迫响应分子机制研究。【方法】以‘紫红’‘黑珍珠’‘翡翠’3个莲雾品种为材料,利用qRT-PCR检测7个候选内参基因ACT-7、GAPDH、UBQ、α-TUB、CYP20-1、EF-2和APRT-5在果实发育和低温胁迫时的表达水平,通过geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder软件进行基因稳定性评价。【结果】不同软件分析结果不同,geNorm、NormFinder和RefFinder结果相似,果肉发育过程、果皮发育过程、低温胁迫下表达最稳定的内参基因分别是ACT-7、α-TUB和CYP20-1,BestKeeper则显示UBQ为表达最稳定的基因。用筛选的内参基因α-TUB和UBQ分析莲雾花青苷合成途径中F3H基因的表达,2者表达规律较一致。【结论】莲雾果肉发育过程、果皮发育过程、低温胁迫下最适的内参基因数分别为4个(ACT-7、GAPDH、UBQ、α-TUB)、2个(α-TUB、UBQ)和2个(CYP20-1、UBQ)。

关键词

莲雾 / 内参基因 / 实时荧光定量PCR

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魏秀清, 章希娟, 许玲, 陈长忠, 许家辉. 莲雾实时荧光定量PCR内参基因的筛选和验证. 果树学报. 2018, 35(04): 402-411 https://doi.org/10.13925/j.cnki.gsxb.20170409

基金

福建省公益类科研院所专项(2017R1013-4); 福建省农业科学院创新团队(STIT2017-2-4);福建省农业科学院院管一般项目(A2017-7)

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