为探究茸毛小长蝽Nysius graminicola(Kolenati, 1845)的线粒体基因组结构及长蝽总科的系统发育关系，利用二代测序方法获得了茸毛小长蝽线粒体全基因组序列。在系统发育分析中，使用长蝽总科17个科52个物种作为内群，并选择缘蝽总科Coreoidea的2个物种作为外群，利用最大似然法和贝叶斯法重建长蝽总科的系统发育关系。茸毛小长蝽的线粒体基因组包含37个基因(13个蛋白质编码基因、22个转运RNA基因和2个核糖体RNA基因)和1个非编码控制区，全长为16 760 bp (GenBank登录号：OQ553818)。茸毛小长蝽线粒体基因组的13个蛋白质编码基因的起始密码子除nad2利用GTG和cox1利用TTG作为起始，其余蛋白质编码基因都是以ATN开头，终止密码子除cox1、cox2、nad3、cob和nad1以不完整的T作为结尾，其余蛋白质编码基因都是以TAA结尾。除trnS1因缺少DHU臂而形成一个简单的环，无法形成稳定的三叶草结构外，其余转运RNA基因均能形成典型的三叶草结构。两个方法构建的系统发育树的结果均表明：长蝽科和地长蝽科为非单系群，梭长蝽科、室翅长蝽科、跷蝽科、杆长蝽科和束长蝽科为单系群。此外，茸毛小长蝽与N.fuscovittatus有较近的亲缘关系。