不同月龄新西兰兔肝中差异蛋白质鉴定与验证

刘方程, 王峰, 毕冬琳, 杨东亮, 杨晓莉, 柏家林, 李琼毅

浙江农业学报. 2023, 35(10): 2299-2310

浙江农业学报 ›› 2023, Vol. 35 ›› Issue (10) : 2299-2310.

不同月龄新西兰兔肝中差异蛋白质鉴定与验证

  • 刘方程, 王峰, 毕冬琳, 杨东亮, 杨晓莉, 柏家林, 李琼毅
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摘要

兔出血症是由兔出血症病毒(Rabbit haemorrhagic disease virus, RHDV)引起的一种兔急性、高度致死性传染病,成年兔死亡率超过90%,但2周龄幼兔不发病。基于幼年兔与成年兔对RHDV的易感性差异,采用串联质谱标记(tadem mass tags, TMT)蛋白质组学技术对幼年兔(2周龄)和成年兔(6月龄)肝中的蛋白质进行检测和定量分析,从幼年兔和成年兔肝中定量获得4 353个蛋白质,筛选出821个差异蛋白质;相较于幼年兔,成年兔肝中294个蛋白质显著上调,527个蛋白质显著下调。GO功能富集分析结果显示,生物学过程主要富集到145个小分子代谢蛋白质、111个与氧化还原过程相关的蛋白质和478个参与代谢过程的蛋白质,细胞组分主要富集到528个细胞外成分蛋白质、139个线粒体蛋白质和366个细胞质蛋白质等,分子功能主要富集到342个催化活性蛋白质、93个氧化还原活性蛋白质和50个辅酶结合蛋白质等。821个差异蛋白质在KEGG Pathway数据库中共注释到47条KEGG信号通路,主要涉及代谢途径、糖代谢、氧化磷酸化作用和剪切小体等通路。幼年兔和成年兔肝中差异蛋白质互作网络分析发现,MRPS15的关联度最高,且差异蛋白质胆固醇酰基转移酶1(ACAT1)在互作网络中具有更多相互作用关系。从蛋白质水平探讨幼年兔和成年兔的感染差异机制,筛选并分析幼年兔和成年兔肝中的差异蛋白质,筛选出的差异蛋白质有望成为RHDV体外扩增细胞系构建的突破点,为构建适宜RHDV体外扩增的细胞系提供新的研究思路。

关键词

新西兰兔 / TMT蛋白质组学 / 兔出血症病毒(RHDV) / / 差异蛋白质

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刘方程, 王峰, 毕冬琳, 杨东亮, 杨晓莉, 柏家林, 李琼毅. 不同月龄新西兰兔肝中差异蛋白质鉴定与验证. 浙江农业学报. 2023, 35(10): 2299-2310

基金

国家自然科学基金(31702234,31860696); 西北民族大学中央高校基本科研业务费项目(31920190003);西北民族大学教学改革研究项目(2020YBJG-43); 甘肃省教育厅高等教育教学成果培育项目(2020GSJXCGPY-07)

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