栏目: 园艺 http://journals.caass.org.cn/zgnykx zh-cn http://journals.caass.org.cn/zgnykx/CN/current.shtml http://journals.caass.org.cn/zgnykx 5 http://journals.caass.org.cn/zgnykx/CN/abstract/abstract56975.shtml 【目的】 葡萄种子因富含多种代谢产物而具有较高生物活性。全面鉴定葡萄种子中代谢物组分，比较分析不同品种间代谢物差异，探讨葡萄种子代谢物与果皮颜色和品种起源之间的关系，为深入开发和利用葡萄种子提供参考依据。【方法】 以紫红色欧美种葡萄‘巨峰’、浅红色欧亚种葡萄‘魏可’和黄绿色欧亚种葡萄‘黄意大利’成熟期种子为材料，利用超高效液相色谱串联质谱（UPLC-MS/MS）进行广泛靶向代谢组学分析，采用多元统计学等方法鉴定和比较代谢物。【结果】 代谢组学数据质量好，组内样品重复性较好，组间样品存在差异。3个葡萄品种种子中共检测到514个代谢物，包括氨基酸、脂类等6类初生代谢物和原花青素、白藜芦醇等20类次生代谢物。不同品种间代谢物种类相似，但含量差异显著。大多数代谢物的相对含量在深色品种‘巨峰’种子中较高，在浅色品种‘魏可’种子中次之，在无色品种‘黄意大利’种子中较低，表明葡萄种子代谢物含量可能与果皮颜色呈正相关。‘魏可’和‘黄意大利’种子代谢物的相对含量较为相近，而均与‘巨峰’种子代谢物的相对含量差异较大，表明葡萄种子代谢物含量可能与品种起源有关。不同葡萄品种间的差异代谢物主要涉及苯丙烷生物合成、花青素合成和脂类代谢等途径。差异代谢物中酚类物质较多，且差异倍数最大的代谢物以类黄酮为主。葡萄种子中酚类和脂类物质种类非常丰富，除了单体黄烷-3-醇及其聚合物外，黄酮和黄酮醇等酚类物质的相对含量也较高；白藜芦醇在3个品种间没有显著差异；溶血磷脂酰胆碱等甘油磷脂含量较高，亚麻酸含量较低，不同品种间脂类物质的相对含量差异较小。【结论】 不同葡萄品种种子中代谢物种类类似，但含量与果皮颜色和品种起源有关。酚类和脂类物质是葡萄种子代谢物的重要组分，可作为食品等加工行业的良好来源。

]]> http://journals.caass.org.cn/zgnykx/CN/abstract/abstract56976.shtml 【目的】 鉴定不同杜梨株系根中响应盐胁迫信号的相关转录因子，分析盐胁迫下基因序列DNA甲基化变化与基因表达改变之间的关系，探讨参与调控不同杜梨株系耐盐能力的转录因子成员。【方法】 以杜梨耐盐株系和普通株系为试材，在苗期使用200 mmol∙L^-1 NaCl对90日龄组培生根苗进行水培处理，以Hoagland营养液为对照。利用火焰石墨炉原子吸收光谱仪测定钠离子含量；利用全基因组DNA甲基化和转录组测序技术从表观遗传修饰和转录调控水平对盐胁迫下转录因子进行生物信息学分析；最后用McrBC-PCR和qPCR对差异转录因子进行验证。【结果】 外源NaCl处理24 h后，杜梨植株中钠离子含量显著增加，其中耐盐株系的增加幅度比普通株系小，为普通株系钠含量的73.1%，但根中积累的钠是普通株系含量的1.1倍；杜梨根中检测到69类共2 682个转录因子的表达，盐胁迫后243个转录因子在两个株系中都发生了差异表达，包括AP2/ERF（37个）、bHLH（19个）、bZIP（7个）、HD-Zip（10个）、MYB（30个）、NAC（18个）、WRKY（8个）和ZFP（23个）等家族成员；盐胁迫后，耐盐株系基因组中转录因子甲基化水平下降，而普通株系转录因子甲基化水平上升，其发生DNA差异甲基化区域主要在基因启动子位置，差异甲基化类型主要为mCHH，占mCG、mCHG、mCHH三种类型总和的93%以上。AP2/ERF、bHLH、DREB、GRAS、GT因子、HB Zip、MYB、NAC、Trihelix和Zinc finger ZFP家族的23个转录因子响应盐胁迫表达量上调而甲基化水平降低，可能参与调节钠在根中的吸收和积累。对部分候选基因的表达模式和启动子区域分别进行实时荧光定量（qPCR）和甲基化依赖型限制性内切酶PCR（McrBC-PCR），验证了生物信息学分析结果。【结论】 盐胁迫后在两个杜梨株系根中均差异表达的转录因子数目为243个，其中8个转录因子（PbERF2、PbGT3、PbZAT10.1、PbSCL33、PbDREB1、PbZAT10.2、PbERF53、PbNAC72）DNA序列的甲基化改变与基因转录水平变化呈负相关，研究结果为揭示转录因子参与不同杜梨株系耐盐能力调控的分子机制提供了依据。

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